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材料物理应用解决方案



某重点大学,材料物理计算应用,单机计算性能强大,同时跨节点运算时无延时

主要应用软件为:Materials StudioQuantum EspressoVASP,Gaussian,LAMMPS,Siesta


针对其应用而设计的一种有针对性的新型计算平台。

采用LZ-628SR-S超级计算机搭建集群应用,同时用户要求整体集群计算运行时,噪音严格控制,因此采用超静音系列超算系统;

集群搭建框架,采用Infiniband QDR(40GB)高速计算网络,同时采用千兆网络环境搭建管理网络,计算节点+24盘位存储I/O

在软件结构上,基于LINUX开源系统环境,MPI并行,编译器,数学库,PBS作业调度,作业管理软件等

软件分析

现有的事实上的并行标准主要有共享内存和消息传递两种编程模式,因此物理、化学和材料计算领域的应用软件也不外乎这两种编程模式。共享内存编程模式主要是通过内存统一编址来实现数据的传递,Gaussian软件是这方面的代表,也是最常用的软件之一。虽然Gaussian软件可以支持通过Linda的消息传递模式,但是和单一操作系统的运行效率相比性能有所下降。消息传递模式并行编程便于程序的扩展性,也是这个领域主要应用所采用的计算模式。计算材料电子结构的vasp是其中典型的应用软件,在微泰WT61上的测试也表明该平台的性能很优异。

软件介绍

Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究:分子能量和结构,过渡态的能量和结构,化学键以及反应能量,分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷和电势,振动频率,红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径。计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态。

Vasp软件

VASP是一个被广泛应用的基于密度泛函方法的从头算量子力学软件包,可以模拟固体、界面和表面的性质,适用于多种材料体系,包括陶瓷、半导体和金属等。第一原理计算允许科学家研究系统的电子、光学和结构性质的本质和根源,除了系统组成物质的原子序数以外,并不需要任何实验数据。因此,VASP非常适用于解决固体物理、材料科学、化学以及化工领域中的问题,在这些领域的研究中,科学家可以应用计算机进行虚拟实验,从而能大大节省实验的费用并缩短研发周期。

 
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